يسعى المركز من خلال هذا القسم لتأهيل طالب العلم المتمكن في الدارسة الشرعية في الفقه والعقيدة واللغة والمصطلح وما يصاحبها من علوم الآلة وعلوم التربية والتزكية, عبر عدد من البرامج العلمية كبرنامج الرائد لتأهيل طالب العلم.